自新石器时代开始，里斯本的地区已经有伊比利亚人居住，最早兴建起来这座古城的是腓尼基人。至公元前205年起为罗马人统治，当时的统治者凯撒把这个地区升格为市，并命名为“Felicitas Julia”（意为“祝贺凯撒”）。可是到公元5世纪起相继被蛮族占领，而在8世纪更被 摩尔人所夺取，信奉伊斯兰教的摩尔人除了在市内兴建了很多清真寺外，还建了很多房屋和新的城墙。而在伊斯兰的统治期间，城市的经济获得了长足的发展，成为这一带重要的海运港口。与此同时，市内住了信奉不同宗教的人如基督徒、穆斯林和犹太人等。

摩尔人统治里斯本直至1147年，他们被阿方索一世率领的十字军击败，使得里斯本重回基督徒的手中。1256年，里斯本正式成为葡萄牙的首都，从此就跃升成为欧洲和地中海一带重要的贸易城市。在地理大发现时代，很多航海家如瓦斯科·达·伽马都是由里斯本出发到世界不同的地方探险的，因此，到了16世纪可算是里斯本最辉煌的时期，大量黄金从当时葡萄牙的殖民地巴西运到里斯本，而这里亦盛产优质的陶瓷制品，使得里斯本成为欧洲富甲一方的商业中心。（详见：葡萄牙殖民帝国）

1506年4月19日，里斯本发生一场针对犹太人的大屠杀，夺走了多达4000名占当时城市1/4人口的犹太人生命。

1755年，里斯本发生了一场大地震，造成城市及港口的严重衰落，从此葡萄牙的国力也开始走下坡。及后在19世纪，拿破仑入侵里斯本，当时的皇室集体逃亡至巴西，而城市也受到一定程度的破坏。第二次世界大战期间，里斯本则是少数开放的大西洋港口城市。现在她是葡萄牙的政治、文化中心，第一大港与第一大城。

1983年，贝伦塔及热诺尼莫修道院（Mosteiro dos Jerónimos）成为世界文化遗产^[1]。

1998年，里斯本主办世界博览会，主题为“海洋，未来的资产”，以配合里斯本海洋城市的特色。博览会举行共132天，总计一千万人次参观。